Ecualizar el sonido en Ubuntu y Pulseaudio es posible desde hace un par de años con un paquete llamado pulseaudio-equalizer. Si bien esto no es ninguna novedad, hoy me he encontrado con problemas para ponerlo en una instalación de Ubuntu 10.10.
sudo add-apt-repository ppa:nilarimogard/webupd8
sudo apt-get update
sudo apt-get install pulseaudio-equalizer
CUIDADO al aplicar las configuraciones de noche o con auriculares, pues resetea el volúmen MASTER al 100%